| 2017年 | 105年度全國性社會團體公益貢獻獎 銀獎 |
| | 「第六屆臺北市暨國家環境教育獎」 團體組 優等 |
| 2016年 | 第四十屆金鼎獎（圖書類出版獎：政府出版品獎）－生物多樣性 4：綠色經濟幸福學 |
| 2015年 | 全國性社會暨職業團體工作評鑑之甲等團體 |
| 2014年 | 103年國家永續發展獎-社團永續發展獎 |
| | 環保署103年環境教育基金補(捐)助成果發表會績優獎 |
| 2013年 | 第七屆總統文化獎-環保獎 |
| | 環保署102年環境教育基金補(捐)助成果發表會績優獎 |
| | 全國性社會暨職業團體工作評鑑之甲等團體 |
| | 陸委會第十七屆兩岸新聞報導獎佳作 |
| | 第一屆綠芽獎（政府出版品-圖書類-成人組-佳作獎）－賞蛙趣、潮汐的呼喚 |
| 2011年 | 第3屆學學獎：綠色公益行動組特別獎 |
| | 第15屆兩岸新聞報導獎非影音新聞報導獎優勝 |
| | 青年國際行動競賽佳作 |
| | 第2屆雲豹網路媒體類文字報導獎 |
| | 行政院青輔會100年「青舵獎」公共事務參與團隊入圍 |
| 2010年 | 榮獲推動環境保護有功特優團體，接受表揚 |
| 2009年 | 卓越新聞獎-第三屆社會公器獎，詳見新聞報導、得獎影片介紹 |
| | 「陽明山生態工作假期」入選青輔會遊學台灣的百大路線 |
| | 「七股護沙生態工作假期」入選青輔會壯遊台灣景點 |
| 2008年 | 「第四屆國家永續發展獎」永續社團類 |
| | 《國際國民信託聯盟組織 International National Trust Organisation》正式會員 |
| | 《國際濕地聯盟 Wetland Link International》正式會員 |
| | 「陽明山生態工作假期」入選青輔會遊學台灣的百大路線 |
| 2007年 | 環境資訊中心獲「第三屆全球華文部落格大獎」訊息／觀點類首獎 |
| | 環境資訊中心獲「網際營活獎優質網站」首獎 |
| | 棲地經營先鋒隊獲「國家青年公共參與獎 NPO經營組」 |
| | 「陽明山生態工作假期」入選青輔會遊學台灣的百大路線 |
| | 「七股生態工作假期」獲第8屆福特保育暨環保獎佳作 |
| 2006年 | 「台東生態工作假期」獲第7屆福特保育暨環保獎優選 |
| 2005年 | 第6屆福特保育暨環保獎佳作 |
| 2004年 | 「第一屆國家永續發展績優獎」社團永續發展類 |
| 2003年 | 入選年蕃薯藤「自然科技類」的 10 大熱門網站排行 |
| 2002年 | 「環境資訊年鑑」獲第3屆福特保育暨環保獎優選 |
| 2000年 | 天下雜誌選為「全球兩百個教育好站」 |
| | 獲「環境新聞服務Environment News Service (ENS)」授權國際環境新聞翻譯 |
